搭起来了一个Linux平台

人类基因组的数据量是在是太大了。全部解压居然有5G++。

我整了一个100M+ Fasta数据下来测试一下，居然电脑就累成这样下：

[root@andLinux ~]# free -m
total used free shared buffers cached
Mem: 377 373 3 0 2 6
-/+ buffers/cache: 364 12
Swap: 255 128 127

物理内存基本上100%被消耗了。

如果把基因数据撤走，则内存恢复为：

[root@andLinux ~]# free -m
total used free shared buffers cached
Mem: 377 21 355 0 2 8
-/+ buffers/cache: 10 366
Swap: 255 10 245

真是没有天理啊。估计正式测算的时候至少要安装4G+内存的电脑才会比较流畅。不能虐待我自己的电脑了。

这两个礼拜先在自己的电脑上摸个门道出来，然后在实验室的电脑安装计算平台，用老板的电脑开算，管他算几天几夜呢。