建议不可与root 分区分开的目录
在Linux的安装里，最重要的就是根目录 / 所在的分区了。我们也可以将其他的例如 /home放在不同的分区里。那么，是否有“一定”要放在root 分区内的目录呢？有，就是/etc/、/sbin/、/bin/、/dev/ 以及 /lib/ 这几个目录。
为什么呢？因为Linux系统在启动时，一开始的核心加载，只会载入一个分区，那就是 /。但是，启动的时候，会用到很多命令与函数库，举例来说，要载入，就需要mount程序，而且我们也需要init程序，还需要用到很多设置文件，例如 /etc/inittab等等。而核心的模块则是放在 /lib里。当然，/dev是所有设备放置的目录，也需要在启动时使用。因此，这些目录都需要跟 / 绑在一起。
建议最好独立成为单一分区的目录
前面提到了最好不要跟 / 分区分离的目录。有些目录则是因为安全性与特殊功能，而希望能够独立一个分区。例如：/home、/usr、/var、/tmp等等。
要知道，系统用户个人家目录在 /home里，这个目录也是可能使用最频繁的目录之一。此外，为了资源分配得较为平均，我们可能会希望针对每个人，限制其可以使用的最大硬盘配额（quota），在这个前提下，就必须将 /home独立出来，而且最好这个分区能够大一点，尤其是Linux是作为文件服务器（file server）的时候，这就更重要了。
/usr则是一些程序安装的目录，也可以独立出来；还有 /var/目录，由于记录了相当多的常用数据，读取很频繁，所以是“很容易出问题的分区”。如果能够将它独立出来，那么当 /var/ 万一不小心毁损时，就不会影响到其他分区，最起码能有一定程度的安全性。
特别重要的目录
除了针对分区的概念来谈目录的重要性之外，有几个比较重要的目录也需要了解一下：
/etc：这个目录是系统设置文件放置位置的地方，包括系统上的账号与密码（/etc/passwd, /etc/shadow），还有启动时所要用到的各项设置值（/etc/sysconfig/*），还有各主要网络服务的设置文件，都在这个目录中。意思就是说，如果这个目录下面的文件被删除或者是死了，系统大概也就需要“花功夫”重建了。因此，一般笔者都会定期将这个目录的所有文件备份下来，反正这个目录的大小应该不会超过50MB才对，多多备份，有备无患。
/usr/local：虽然说当前已经将这个目录的重要性移动到 /opt了，但是笔者还是比较习惯将自己开发或自行额外安装的软件放在这个 /usr/local目录下。如果Linux系统是多人共享的话，那么，养成良好的操作习惯是有必要的。那么安装软件也要有好习惯，不要随意安装。统一放在 /usr/local或者是 /opt下面。
/var：上面提过一次，这里再次强调。这个目录是在管理系统运行过程中的重要中间暂存数据的，例如 /var/lib与 /var/run。此外，最终的数据例如邮件 /var/spool/mail也是放在这个目录中。另外，几乎所有服务的登录文件（可以记录谁、什么时候、由哪里登入主机、做了什么事等等信息）。都放在 /var/log这个目录，因此，这个目录也很重要。记得常常去检查 /var/log/messages这个文件是否有异常。
