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Ubuntu安装QIIME2-2017.8版本

时间:2017-09-10来源:linux网站 作者:metlab_work
前期准备:进入Ubuntu系统,保持网络畅通。
 
方法:
1.打开终端,输入“sudo -s”获取root权限;输入“python -V”检查python版本
 
2.安装Miniconda: 前往http://conda.pydata.org/miniconda.html下载与Python相适宜的版本
 
3.下载后,为避免出现找不到命令的情况,在下载文件夹下打开终端,输入“bash Miniconda”(右键.sh文件属性获取全部文件名)→回车表示统一安装协议→空格翻到底,读完协议→输入“yes”安装在默认路径下→输入“yes”,即可完成安装
 
4.关闭终端(非常重要)
 
5.打开终端,输入“conda”(输出屏幕conda 的文档表示安装成功),输入“conda create -n qiime2-2017.8 --file https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2017.8-conda-linux-64.txt”,然后会问你是否安装,输入“y”,将会自动安装QIIME2-2017.8版本,等待安装完成,再输入“conda create -n qiime2-2017.8 --file https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2017.8-conda-linux-64.txt”,程序会告诉你是否已安装成功
 
6.任意路径下,加载qiime2,输入“source activate qiime2-2017.8”,(输入后,每条命令行的开头都会自带一个(qiime2))
 
7.测试QIIME2,输入“print_qiime_config.py -t”(输入后,会进行测试,最终返回版本信息及一系列配置参数,表示安装成功)
Ubuntu安装QIIME2-2017.8版本
 
8.使用QIIME分析数据
 
9.分析完毕,输入“sourcedeactivate” 退出
 
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